郑州一病例7天7次核酸后才确诊,奥密克戎会使现有试剂脱靶吗?

国家卫生健康委员会官网、中国新闻周刊、河南日报 2022-01-17

1月12日,郑州市新冠肺炎疫情防控指挥部办公室披露的一起确诊病例引发关注。据通报,当地96号病例在连续7天7次核酸检测后才最终确诊。再加之河南已经出现奥密克戎本土传播,人们不仅疑惑,奥密克戎会使现有试剂脱靶吗?


经多次核酸检测才呈阳性的现象并非首次出现。早前,西安也曾出现7次核酸后才确诊的病例。“石家庄有人核酸检测6次才呈阳性”不久前也登上热搜。去年,深圳甚至出现过核酸11次确诊的情况。梳理全国各地公布的确诊病例详细信息,不难发现其中存在大量经多次核酸检测才呈阳性的病例,即使不是奥密克戎突变株,也存在这种情况。


目前,中国已经出现奥密克戎突变株的本土传播,相较于之前流行的新冠毒株,奥密克戎具有更多的突变和更强的传染性,传播更为隐匿。那么从检验医学的角度讲,传染性更强的奥密克戎,是否会使现有的核酸检测试剂脱靶呢?之前报告的多例多次核酸检测阴性但最终确诊的病例原因何在?




传染性强不等于检测难度大


2021年11月9日,南非首次从病例样本中检测到一种新冠病毒B.1.1.529变异株。短短2周时间,该变异株即成为南非豪登省新冠感染病例的绝对优势变异株,增长迅猛。11月26日,WHO将其定义为第五种“关切变异株”(variant of concern, VOC),取名希腊字母Omicron(奥密克戎)变异株。


根据新冠病毒数据库GISAID目前共享的信息显示,新冠病毒奥密克戎变异株的突变位点数量明显多于近2年流行的所有新冠病毒变异株,尤其在病毒刺突(Spike)蛋白突变较多。奥密克戎变异株同时具有前4个VOC变异株Alpha(阿尔法)、Beta(贝塔)、Gamma(伽玛)和Delta(德尔塔)刺突蛋白的重要氨基酸突变位点,包括增强细胞受体亲和力和病毒复制能力的突变位点。


研究表明,新冠病毒S蛋白若出现K417N、E484A或N501Y突变,提示免疫逃逸能力增强;而奥密克戎变异株同时存在“K417N+E484A+N501Y”三重突变。这也导致了奥密克戎对于疫苗的免疫逃逸能力增强,美国在奥密克戎突袭下,之前日新增确诊病例曾高达百万之多。虽然一般认为奥密克戎突变株感染症状相对较轻,但其强大的传播力仍使欧美各国应接不暇,连续推出疫苗加强针计划以应对。


对奥密克戎变异株的基因组分析显示,其突变位点不影响我国主流核酸检测试剂的敏感性和特异性。奥密克戎变异株突变的位点主要集中在S蛋白基因的高变异区,并不位于我国第八版《新型冠状病毒肺炎防控方案》公布的核酸检测试剂引物和探针靶标区域(中国疾控中心病毒病所向全球公布的ORF1ab基因和N基因)。通俗地说,就是病毒感染人的基因位点虽然发生突变,但是检测试剂检测的并不是这些发生突变的位点,而是演化上更为保守的位点。但南非多个实验室的数据提示,对于检测靶标为S基因的核酸检测试剂可能无法有效检出奥密克戎变异株的S基因。





多次核酸检测阴性仍确诊,另有原因


据《大河报》报道,郑州市疫情防控咨询电话一名工作人员介绍,96号病例女子检测的情况属正常,可能涉及到采样、标本、检验方式等多个原因,“病毒并非24小时都会出现在咽部,有可能在其他地方,这也是郑州开展多轮核酸检测的必要性。”
流行病学专家、复旦大学公共卫生学院教授姜庆五也表示,经过多次核酸才确诊不是病毒变异的原因,更大的可能是检验程序上的问题。当事人做检测时病毒可能尚未在检测部位出现。以常见的咽拭子检测方式为例,通常只有当病毒从肺部排出到喉咙时,才能被采样管检测到。但这一过程需要多长,很难有准确的答案,“这是一个常见的生物学现象,不是每一次病我们都能查得到的”。他同时指出,毒性强弱与是否能够被检测是两个概念,只要检测部位客观存在病毒,最终都能被查出来。
北京协和医院感染内科副主任曹玮也指出,目前研究证实新冠病毒在咽部复制和排出体外的最活跃时间是在出现临床症状前后,此时咽部核酸检测呈现阳性的可能性最高。假如核酸检测时,病人恰好排毒量少,检测结果就可能呈阴性。所以,反复多轮检测更显得有必要。


中国疾控中心副主任冯子健去年曾在接受采访时也谈及此现象。他给出的解释是:感染者或是病人从暴露感染到病毒开始排毒,专业上叫“强隐期”,而无症状感染者排毒专业上叫做“ 前隐期 ”,也可以叫实验室检测筛查的窗口期。在窗口期期间,检测很多次都可能检不到阳性,但到前隐期末就会检出阳性,“这个现象是完全可以理解的 。”



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