流式细胞仪的使用程序
一．开机程序
1 ．检查稳压器电源，打开电源，稳定5分钟。
2 ．打开储液箱，倒掉废液,并在废液桶中加入400ml漂白水原液。打开压力阀，取出鞘液桶，将鞘液桶加至4/5满（一般可用三蒸水，做分选必须用PBS或FACSFlow），合上压力阀。确实盖紧桶盖，检查所有管路是否妥善安置。
3 ．将FACSCalibur开关打开，此时仪器功能控制钮的显示应是STANDBY，预热5－10分钟。排出过滤器内的气泡。
4 ．如果需要打印，打开打印机电源。
5 ．打开电脑,等待屏幕显示出标准的苹果标志。
6 ．执行仪器PRIME功能一次，以排除Flowcell中的气泡。
7 ．分析样品时，先用FACAFlow或PBS进行HIGHRUN约2分钟。
X.做过分选后，每次开机后需冲洗管道：向分选装置上装上两个50ml离心管，不接通浓缩系统，摁下右下角白色按钮开始冲洗。待自动停止后接通浓缩装置，同上法冲洗一次。
二．预设获取模式文件(AcquisitionTemplateFiles)
1 ．从苹果标志中选择CELLQuest见一个新视窗，可利用此视窗编辑一个获取模式文件。
2 ．选取屏幕左列绘图工具中的Dotplot，绘出一个或多个DotPlots（点图）。从DotPlot对话框中选取Acquisition作为图形资料来源，并确定适当的x轴和y轴参数。
3 ．选取屏幕左列绘图工具中的Histogram，同上法可绘出Histogram（直方图）。
4 ．将此视窗命名后储存于FACStationG3BDApplicationsCELLQuestFolderEXP文件夹中，下次进行相同实验时可直接调用。
X.本计算机中已设定两个模式文件：ACQ和EXP，储存于FACStationG3BDApplicationsCELLQuestEXP文件夹中，ACQ用于细胞DNA检测，EXP用于细胞表面标志分析。
三．用CELLQuest进行仪器的设定和调整
1 ．从苹果画面中选取CELLQuest，进入CELLQuest后在File指令栏中打开合适的获取模式文件。
2 ．从屏幕上方Acquire指令栏中，选取ConnecttoCytometer（快捷键：＋B）进行电脑和仪器的连机。将出现的AcquisitonControl对话框移至合适位置。
3 ．从Cytometer指令栏中，开启Detectors/Amps、Threshold、Compensation、Status等四个对话框，并将它们移至屏幕右方，以便获取数据时随时调整获取条件。也可以用+1，2，3，4获得此四个对话框。
4 ．在Detectors/Amps对话框中，先为每个参数选择适当的倍增模式(amplifiermode)：线性模式Lin或对数模式Log。一般进行细胞表面抗原分析如分析外周血的淋巴细胞亚群时，FSC和SSC多以线性模式Lin测量，且DDMParam选择FL2，而FL1,FL2与FL3则以对数模式Log测量；分析细胞DNA含量时，FSC，SSC，FL1，FL2，FL3皆以Lin进行测量，且DDMParam选择FL2；分析血小板表型时，FSC，SSC，FL1，FL2，FL3等均以Log进行测量。
5 ．放上待检测的样品，将流式细胞仪设定于RUN，流速可在HIGH或LOW上。
6 ．在AcquisitonControl对话框中，选取Acquire，开始获取细胞。在以下的仪器调整过程中随时选取Pause，Restart以观察调整效果。未完全调整好之前不要去掉SETUP前的“3”。
7 ．在Detectors/Amps对话框中，调整FSC和SSC探测器中的信号倍增度：PMTvoltages（粗调）与AmpGains（细调），使样品信号出现在FSC-SSC点图内,且三群细胞合理分布。
8 ．在Threshold对话框中选择适当的参数设定Threshold，并调整Threshold的高低，以减少噪音信号（细胞碎片）。一般做细胞表型时用FSC－H而做DNA时用FL2－H。Threshold并不影响检测器对信号的获取，但可改善画面质量。
9 ．从屏幕左列绘图工具中选取Region（区域），并在靶细胞周围设定区域线，即通常所说的门。圈定合适的细胞群可使仪器调整更为容易。
10 ．在Detectors/Amps对话框中，调整荧光检测器（FL1,FL2,FL3,FL4等）的倍增程度。根据所用的荧光阴性对照样品调整细胞群，使之分布在正确的区域内。
11 ．在Compensation对话框中，根据所用的调补偿用标准荧光样品调整双色（或多色）荧光染色所需的荧光补偿。比如应该为FL1+FL2-的细胞群却分布在FL1＋FL2＋区域内，则需调大FL2－？％FL1中的“？”，并从FL1-FL2点图中观察新的调整是否恰当
12 ．在Status对话框中可见：LaserPower:正常值—Run/Ready为14.7mW，Standby为5mW；Lasercurrent:正常值为6Amps左右。
13 ．调整好的仪器设定可在InstrumentSettings对话框中储存，下次进行相同实验时可调出使用，届时只需微调即可。
X.本计算机中已有三个名叫储存于FACStationG3BDApplicationsCELLQuestFolderIMM-InstrSettings及FACStationG3BDFilesInstrumentSettingsFilesCalibFile和Mast-Cell-Set的参数文件，前二者可用于分析人白细胞，后者用于分析小鼠肥大细胞。
四．通过预设的获取模式文件进行样品分析
1 ．从苹果标志中选择CELLQ
1 ．检查稳压器电源，打开电源，稳定5分钟。
2 ．打开储液箱，倒掉废液,并在废液桶中加入400ml漂白水原液。打开压力阀，取出鞘液桶，将鞘液桶加至4/5满（一般可用三蒸水，做分选必须用PBS或FACSFlow），合上压力阀。确实盖紧桶盖，检查所有管路是否妥善安置。
3 ．将FACSCalibur开关打开，此时仪器功能控制钮的显示应是STANDBY，预热5－10分钟。排出过滤器内的气泡。
4 ．如果需要打印，打开打印机电源。
5 ．打开电脑,等待屏幕显示出标准的苹果标志。
6 ．执行仪器PRIME功能一次，以排除Flowcell中的气泡。
7 ．分析样品时，先用FACAFlow或PBS进行HIGHRUN约2分钟。
X.做过分选后，每次开机后需冲洗管道：向分选装置上装上两个50ml离心管，不接通浓缩系统，摁下右下角白色按钮开始冲洗。待自动停止后接通浓缩装置，同上法冲洗一次。
二．预设获取模式文件(AcquisitionTemplateFiles)
1 ．从苹果标志中选择CELLQuest见一个新视窗，可利用此视窗编辑一个获取模式文件。
2 ．选取屏幕左列绘图工具中的Dotplot，绘出一个或多个DotPlots（点图）。从DotPlot对话框中选取Acquisition作为图形资料来源，并确定适当的x轴和y轴参数。
3 ．选取屏幕左列绘图工具中的Histogram，同上法可绘出Histogram（直方图）。
4 ．将此视窗命名后储存于FACStationG3BDApplicationsCELLQuestFolderEXP文件夹中，下次进行相同实验时可直接调用。
X.本计算机中已设定两个模式文件：ACQ和EXP，储存于FACStationG3BDApplicationsCELLQuestEXP文件夹中，ACQ用于细胞DNA检测，EXP用于细胞表面标志分析。
三．用CELLQuest进行仪器的设定和调整
1 ．从苹果画面中选取CELLQuest，进入CELLQuest后在File指令栏中打开合适的获取模式文件。
2 ．从屏幕上方Acquire指令栏中，选取ConnecttoCytometer（快捷键：＋B）进行电脑和仪器的连机。将出现的AcquisitonControl对话框移至合适位置。
3 ．从Cytometer指令栏中，开启Detectors/Amps、Threshold、Compensation、Status等四个对话框，并将它们移至屏幕右方，以便获取数据时随时调整获取条件。也可以用+1，2，3，4获得此四个对话框。
4 ．在Detectors/Amps对话框中，先为每个参数选择适当的倍增模式(amplifiermode)：线性模式Lin或对数模式Log。一般进行细胞表面抗原分析如分析外周血的淋巴细胞亚群时，FSC和SSC多以线性模式Lin测量，且DDMParam选择FL2，而FL1,FL2与FL3则以对数模式Log测量；分析细胞DNA含量时，FSC，SSC，FL1，FL2，FL3皆以Lin进行测量，且DDMParam选择FL2；分析血小板表型时，FSC，SSC，FL1，FL2，FL3等均以Log进行测量。
5 ．放上待检测的样品，将流式细胞仪设定于RUN，流速可在HIGH或LOW上。
6 ．在AcquisitonControl对话框中，选取Acquire，开始获取细胞。在以下的仪器调整过程中随时选取Pause，Restart以观察调整效果。未完全调整好之前不要去掉SETUP前的“3”。
7 ．在Detectors/Amps对话框中，调整FSC和SSC探测器中的信号倍增度：PMTvoltages（粗调）与AmpGains（细调），使样品信号出现在FSC-SSC点图内,且三群细胞合理分布。
8 ．在Threshold对话框中选择适当的参数设定Threshold，并调整Threshold的高低，以减少噪音信号（细胞碎片）。一般做细胞表型时用FSC－H而做DNA时用FL2－H。Threshold并不影响检测器对信号的获取，但可改善画面质量。
9 ．从屏幕左列绘图工具中选取Region（区域），并在靶细胞周围设定区域线，即通常所说的门。圈定合适的细胞群可使仪器调整更为容易。
10 ．在Detectors/Amps对话框中，调整荧光检测器（FL1,FL2,FL3,FL4等）的倍增程度。根据所用的荧光阴性对照样品调整细胞群，使之分布在正确的区域内。
11 ．在Compensation对话框中，根据所用的调补偿用标准荧光样品调整双色（或多色）荧光染色所需的荧光补偿。比如应该为FL1+FL2-的细胞群却分布在FL1＋FL2＋区域内，则需调大FL2－？％FL1中的“？”，并从FL1-FL2点图中观察新的调整是否恰当
12 ．在Status对话框中可见：LaserPower:正常值—Run/Ready为14.7mW，Standby为5mW；Lasercurrent:正常值为6Amps左右。
13 ．调整好的仪器设定可在InstrumentSettings对话框中储存，下次进行相同实验时可调出使用，届时只需微调即可。
X.本计算机中已有三个名叫储存于FACStationG3BDApplicationsCELLQuestFolderIMM-InstrSettings及FACStationG3BDFilesInstrumentSettingsFilesCalibFile和Mast-Cell-Set的参数文件，前二者可用于分析人白细胞，后者用于分析小鼠肥大细胞。
四．通过预设的获取模式文件进行样品分析
1 ．从苹果标志中选择CELLQ
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