NuGen引进下一代测序靶向富集技术
NuGen Technologies公司——下一代测序(NGS)应用解决方案开发的市场领导者,发布了一种新型的靶向富集方法,将在单一试验中检测出所有可能的基因融合事件,包括韦尔科姆基金会桑格研究所《肿瘤体细胞突变目录》(COSMIC)列出的446种癌症融合基因。
这项技术是NuGen专有的,采用独特的单引物方法,只需要将一个同伴外显子作为靶标,从而不仅可以检测已知的基因融合事件还可以发现新的基因融合和选择性剪接形式。
NuGen专有的单引物富集技术(SPET)是低丰度基因融合转录本的高灵敏检测方法的核心技术,只需要新鲜组织或者福尔马林固定石蜡包埋组织的共10 ng RNA。这种简单、成本效益高的试验采用一天即可完成的快速工作流程。
NuGen研发部副总经理Doug Amorese说,迄今为止为了获得广泛的基因融合而进行样品筛查是一个昂贵又耗时的过程。以RNA测序为目标的SPET技术使NGS分析可以识别目标基因组内的所有融合事件,对于基础研究和基于RNA测序的癌症诊断和预后试验的开发都是一种重要的方法。
Ovation基因融合组合靶向富集系统查询了5,769个外显子,获得8、32和96个反应条形码以便有效生成文库和进行成本效益高的测序分析。
另外,还可以按照用户特定需求,利用相同技术自定义基因融合组合。NuGen诊断市场拓展部副总经理Joe Don Heath说,他们正与当前在临床研究项目中使用标准的Ovation基因融合组合靶向富集系统的伙伴合作,希望未来研发出用于临床检验的自定义融合组合。
NuGen总部位于加利福尼亚州圣卡洛斯市,为靶向富集产品提供定制设计服务,从设计到交货的时间为3周,在样品制备技术的供应上拥有积极的诊断合作项目。
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信源:http://www.clpmag.com/2014/08/nugen-introduces-ngs-target-enrichment-technology/