Sci Transl Med：有效诊断遗传疾病的新方法
被怀疑患有遗传病的人当中，只有不到一半的的人能真正得到满意的诊断。目前，柏林大学医院中心区分院（Charité - Universitätsmedizin Berlin）和马克思普朗克分子遗传学研究所的科学家们，将新一代测序技术（NGS）、生物信息学和临床数据进行整合，开发出一种有效的诊断程序，可显著增加受影响患者的诊断前景。该程序免费提供给相关医疗机构，并可以立即使用。相关研究结果发表在最近的《科学转化医学》（Science Translational Medicine）杂志。
要实施合适的治疗，第一步是准确的诊断——即使在无法医治的情况下，这是非常重要的。PhenIX诊断程序的开发者之一Peter Robinson称：“至少，它提供了保证，疾病不是由自己造成的。”PhenIX代表“Phenotypic Interpretation of eXomes”。在过去，只能对这类疾病进行遗传学分析。然而，这往往不足以准确地检测疾病。所有检测的问题在于，患者的个体差异使诊断变得很困难，来自于每个人固有规范的数百万个遗传偏差当中，必须找到重要的差异。
为了解决这个问题，柏林的科学家们开发了一种创新性的诊断程序。与以往的诊断检测方法形成对照，PhenIX将遗传异常分析与患者的临床表现结合起来。在第一步中，进行一个特定的搜索，寻找已知引起疾病的大约3000个基因。为了找出它们是哪些基因，科学家们系统地搜索了公开可用的数据库，并创建了已知遗传缺陷的一个列表。一旦这些工作完成，几百个遗传异常通常仍然停留在患者的基因组中，作为候选的疾病起因。
第二步中，主治医师浏览Human Phenotype Ontology (HPO)——Charité开发的一个数据库，以寻找患者的症状。这也包含可能引起疾病的遗传缺陷的一个列表。然后，当医生检测两种分析方法之间的重叠时，会发现一个候选者列表，往往包含不超过20种可能的病因，包括按概率排序。通过这个列表检测疾病，相对比较容易。
在试点研究中，研究人员检测了一组患者，他们的遗传疾病是已知的。在每一个病例中，PhenIX都能正确地诊断疾病。其他一些患者也接受了检测，尽管进行了多年的努力密集调查，这些人并没有获得诊断。当使用PhenIX方法时，这些患者中有超过25%的人能够找出他们的确切病因。
PhenIX可用于具备必要技术装备的医院。Robinson称：“通过临床表现与遗传分析相结合，我们已经向前迈进了一大步——新方法意味着医生只需要两小时的工作。”他承诺，即使在未来，这个程序的一个免费版本将是始终可用的。他认为，将来有望进一步改善数据库的更标准化处理。他这样说道：“医生有时候不知道应该如何确切地描述一种症状，或者他们知道特定的症状有不同的名称。”一定的准则，可使搜索过程更加成功，因此，在未来诊断可以变得更快速和更准确。
