NGS和数字PCR的技术应用

血源性病原体指可以通过血液及血液之外的体液传播疾病的一些病原体，包括精液、阴道分泌物、羊水、关节腔积液等组织液可以进行疾病传播。污染病原体的血液输入或者种入患者体内会引起相应的感染或者疾病。众所周知，现在输血前要检测很多病原体，包括HBV、HCV、HIV、梅毒等，试剂审批的过程当中，筛查血源性病原体的试剂是按照药品管理的。血源性病原体感染疾病的传播途径主要是性接触、母婴垂直传播、血液传播等途径，易感人群主要包括吸毒人群、透析患者、护理，还有同性恋人群和免疫力低下人群，感染分类分为：一过性感染、隐匿性感染、...

病原宏基因组测序（mNGS）的特点是不需要培养，不需要前提假设，从临床样本中提取核酸，利用基因组学的方法研究样品中所有微生物的种类和含量。涵盖了细菌、病毒、真菌和寄生虫等各种可能性。不需要假设意味着不需要提前推测可能是什么样的病原体，从而再采取相应的检测方法检测，mNGS可以“一网兜”地检测出来。这样先进的技术过去几年在临床大量应用。同时临床也发现了许多问题，例如，序列数是否能够真实反映标本的病原载量？在有些标本中只能测到一条结核或军团菌或者测得1000条非结核分枝杆菌（NTM）。序列数多高就意味着样本当...

宏基因组学测序技术（mNGS）是一种无需培养，无需预设就可以深入快速鉴定感染病原体的新技术，这比培养等传统方法学拥有更高敏感性的同时又与精准诊疗的理念相契合。对于辅助临床精准抗感染，进一步提升患者预后和生命体验，具有重要的意义。本文从新技术、新工具、新发现、新想法以及新应用五方面进行阐述。...

全球侵袭性真菌病（IFD）流行形势严峻，每年造成超过200万人死亡，中国每年有超过500万人受到IFD的威胁。IFD起病隐匿且临床症状不典型，早期诊断困难，加之新发致病菌及多药耐药菌种不断出现，更增加了诊疗难度。为提高IFD的诊治水平，国内外针对IFD的不同宿主人群、不同致病真菌推出了一系列临床诊疗相关指南或共识。...

【摘要】目的 最近使用单分子实时(SMRT)测序的研究显示，血浆中存在大量可分析的长细胞游离DNA（cfDNA），这种长cfDNA在妊娠和癌症方面的潜在临床应用已经得到证实，然而，不同的长读测序平台对长cfDNA的分析性能仍然未知。方法 使用不同大小超声处理的人和小鼠DNA的人工混合物评估了PacBio的SMRT测序和ONT的纳米孔测序的长度偏好，使用两个平台对不同妊娠期孕妇、乙肝携带者和肝癌患者的血浆cfDNA进行测序。结果 两个平台均显示出对更长DNA片段（1500bp vs 200bp）的测序偏好，...

【摘要】背景 可以检测多种癌症类型或多癌症早期筛查（MCED）的检测最近已成为降低癌症发病率和死亡率的潜在新工具。大多数MCED分析基于检测血液中的肿瘤细胞游离DNA（CF-DNA）。无论是否进行推荐的筛查，MCED都有可能筛查出死亡率高的癌症器官部位。在确定MCED临床效用之前，必须证明MCEDs的临床有效性，即它们预测癌症状态的能力。在这项研究中，我们对基于细胞游离核酸MCED检测对癌症的预测能力进行了系统评价。...

【摘要】目的 肺炎虽然是常见的疾病和导致死亡的原因，但仅在少数病例中鉴定出病原体。而血浆微生物细胞游离DNA的测序，则有望提高肺炎合并免疫功能低下患者的诊断率。方法 在这项前瞻性、多中心、观察性研究中，免疫功能低下的成年人接受支气管镜检查以确定肺炎病因，将血浆微生物细胞游离DNA测序与标准化的常规检查进行比较。肺炎病因由一个独立的盲选委员会裁决。主要结果（实验数据）、附加诊断价值（临床诊断价值），皆符合方案数据分析（具有完整检测结果且无主要方案偏差的患者），并计算通过血浆微生物细胞游离DNA测序完全确定肺...

随着癌症诊疗技术的不断进步与发展，WHO指出，癌症有1/3完全可以预防；还有1/3的癌症通过早期发现能得到根治。而其中早诊早治是提高癌症生存率的关键。...

【摘要】目的 地中海贫血是遗传性血液疾病，也是迄今为止全球最常见的单基因疾病之一。β-地中海贫血在塞浦路斯的患病率特别高，IVSI-110 G＞A（HBB：c.93-21G＞A）致病性变异占总携带者的近79%。母体血浆中存在3%-20%的胎儿游离DNA（cffDNA），这一发现使β-地中海贫血等单基因疾病的无创产前诊断（NIPD）得以发展，从而避免了侵入性操作的风险。...

宏基因组测序技术（metagenomic next-generation sequencing，mNGS）通过对样本中的所有核酸进行测序并对数据进行分析，来识别病原微生物的核酸序列，以诊断感染性疾病的致病原因。该技术具有无偏移、全覆盖、高效率等优势，无需培养，可一次性完成细菌、真菌、病毒和寄生虫等多种病原体检测，是感染疾病诊断领域唯一的精准诊断和个体化医疗技术。mNGS的整体技术流程可以分为湿实验和干实验两部分，本文针对这两部分流程中我们所做的工作与心得体会向同道进行分享。...

【摘要】目的 评价湖南乐准生物科技有限公司（以下简称乐准公司）的脑利钠肽（以下简称BNP）检测试剂（磁微粒化学发光法）的性能。方法 对检测试剂盒的空白限、检出限、线性范围、正确度、精密度、抗干扰性、与参比试剂的相关性及阴阳性符合率进行评价。结果 试剂盒空白限实测0.64pg/ml，检出限5pg/ml；线性范围为5.0-5000.0 pg/ml，相关系数为0.999；正确度参考品测试结果在靶值的95%置信区间之内；精密度小于10%；样本中血红蛋白＜5.00g/L，胆红素＜0.2g/L，甘油三酯＜30.0g/...

现病史：患者近2个月以来出现不自主头部抖动，伴有记忆力减退、嗅觉减退，伴有动作减慢、走路不稳，觉肢体僵硬，情绪紧张时抖动加重，休息及心情放松时可以好转，但不能完全缓解，睡眠状态不抖，上述症状逐渐加重，为进一步诊治，于2023年2月2日就诊，以“头部不自主抖动待诊”收入院。患者自发病以来，精神可、食欲、睡眠可，大小便正常，体重无明显变化。...

噬血细胞综合征（HLH），是由遗传性或获得性免疫功能异常导致的以病理性炎症反应为主要特征的临床综合征。患者持续性发热、肝脾肿大、血细胞减少和骨髓、肝、脾、淋巴结组织中发现噬血现象为主要临床特征。HLH病程凶险，进展迅速，未经诊疗中位生存期多小于2个月。由于其病因及临床多样，极易误诊，因此，快速准确诊断HLH对患者预后及生存有重要意义。现对本院确诊并及时救治成功的噬血细胞综合征（HLH）一例患者进行分析。...

凝血岗位同事发现一患者凝血功能异常，PT 29.8s延长、INR 2.47升高、APTT 166.9s明显延长、TT 21.7s正常、FIB 1.45g/L降低、DD 5.61mg/L升高。APTT危急值引起检验科医生注意。...