ASM Microbe 2016现场报道

作者: Will Xavier
2021-12-16

成立于1899年的美国微生物学会(American Society for Microbiology,ASM),一百多年来一直致力于推进微生物科学的进展。作为拥有超过47,000名会员的世界最大单一生命科学团体,ASM设置有完备的组织结构来实现其在全球微生物学的领导地位,包括ASM微生物学院、出版社、教育机构、国际事务部、全球化实验室体系、生物资源中心、学术期刊及专家委员会。


借白宫新近启动的“国家微生物计划”东风,今年6月17-20日,ASM在美国波士顿举办了ASM Microbe 2016大会。ASM主席David Hooper博士指出,本次大会是首次将ASM年会与抗菌剂与化疗跨学科会议(Interscience Conference on Antimicrobial Agents and Chemotherapy[ICAAC])合并在一起,从而首次在微生物学领域实现从基础研究、到转化研究,再到临床应用的全方位多学科整合,使得与会者能够在一次参会中获得微生物领域最广泛和最新的信息。本次会议,ASM不仅从规模上比以往要大很多,会期也更长,更重要的是,还邀请到Bill Gates先生作为开场嘉宾,足见其重视程度。


果然,为争先一睹盖茨先生的风采,会议开始前一小时便排起长队。现场访谈由ABC新闻网健康与医疗事务首席新闻官Richard Besser博士主导进行,盖茨先生向大家介绍了Bill & Melinda Gates基金会是如何在全球落后地区进行健康福利普及的,尤其提到将5岁以下婴儿的死亡率从1990年代的9.1%降低到了2005年的4.3%。此外,盖茨先生还提到,提高落后地区的疫苗接种率,提供更多的药物,并且开发出被忽视的热带疾病的治疗方案,都是提高全球健康战略的重要组成部分。盖茨先生最后总结道,这些诉求都可以通过加强对微生物学的革新来实现。

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Bill Gates先生致辞

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Bill Gates先生访谈


本次会议主要分为学术交流及商业展览两大部分。学术交流的主题包括微生物基因组学、微生物与环境相互作用、与微生物相关的基因编辑、抗药性、病毒相关内容、微生物与免疫系统相互作用、食源性微生物的致病性、微生物的检测与诊断等,超过11,000名注册参会者也创下了ASM历届会议之最。虽然只是针对于微生物的会议,但参展商确丝毫不见减少,还有不少产品也是最新研发的成果。


首先当然是测序领域的公司与产品,Thermofisher在展会上依然主要介绍其 Ion PGM™测序仪及其配套试剂盒,对于研究微生物基因组结果的科学家而言,de novo测序以及对全基因组的拼接是非常重要的步骤。通过提供简单、低成本的系统,Ion torrent可在1天之内就完成针对于微生物研究的de novo测序。


Illuminia当然也提供了针对于多种微生物的全基因组测序、16rRNA测序、针对于宏基因组学的鸟枪法测序,以及针对埃博拉、寨卡、流感等病毒的测序等解决方案,还展出了更小、更经济的MiniSeq二代测序仪及其配套试剂。


Pacific Biosciences也同样展出了其具有SMRT®技术(single molecular real-time technology)的主打产品PacBio RS II测序仪,以及专门针对于微生物与传染性疾病相关的试剂盒。其更长的测序读长、更高的一致性准确率和同步进行表观遗传学分析的能力,相信能够在市场中赢得先机。


值得关注的是,来自于英国的Nanopore公司也在展会上展出了其手持测序仪产品,如果以iphone 6的尺寸为单位的话,其实物大小大概相当于的iphone 6的长度,2/3宽度, 4-5倍厚度,且无需进行扩增前PCR处理,读长最长能够达到230-330KB,实在是一款革命性的测序仪产品。


除了测序技术,一直从事于芯片技术的Affymetrix公司也展示了其微生物相关领域的产品,例如全基因组基因分型研究和农业基因组解决方案等。相信熟悉本领域的同志们都了解,今年4月,Affymetrix公司已成为Thermofisher的一部分,所以其产品线将与Thermofisher产品进行进一步的整合与协调。


在微生物领域,对微生物进行鉴定当然是所有研究/诊断工作的基础。在本次会议上,涉及微生物培养和鉴定的公司更是你方唱罢我方登场。


BD公司的KIESTRA™微生物实验室自动化工作站率先提出了微生物实验室全自动化流水线概念,并持续推出创新解决方案,致力于提高检验速度和质量、节约人力成本、优化实验室流程。目前该工作站在全球已有超过120多家用户。其优势在于:首先实现了各类型标本(液态/非液态)标准化、可追溯、可重复的全自动过程,极大地提高检测结果的准确性。其次,通过优化检测流程,缩短了检测周期,为患者的诊治提供更快更准确的临床依据,提高医院感控能力。例如:专利磁性滚珠技术获得的单克隆菌落数量是手工划线法的3~5倍;自动孵育及动态影像检测,可显著地缩短培养时间;智能软件及专家系统可提高临床报告的准确性和缩短报告时间等。第三,提高实验室工作效率,帮助解决检验人员不足的问题。第四,提高实验室安全保障,降低生物安全事件的发生。最后,通过模块化的设计满足实验室不同阶段的需求。除此之外,BD公司还展示了其BD BACTEC™血培养系统,快速检测甲乙型流感的BD Veritor™系统,以及快速检测HSV病毒的BD ProbeTec™ HSV Qx分析系统等产品。


作为以微生物研究起家的生物梅里埃(Biomerieux)公司,其在微生物鉴定领域的API、VITEK,VIDAS等系列产品相信大家都非常熟悉。而随着技术的进步,梅里埃公司更是把微生物的鉴定从常规的形态、生化、分子三个层面升级到了利用质谱学技术来进行快速检测,VITEK MS™就是在这样趋势下应运而生的新一代微生物鉴定技术平台。通过利用不同微生物菌株具有不同的蛋白指纹图谱这一特性,利用基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱(MALDI-TOF)技术,可以直接对微生物菌落进行快速鉴定,将以往的检测时间从数天缩短到数分钟之内。该系统还可以与VITEK系统2相连接,通过创新终端软件(Myla™),提供微生物的一站式鉴定及药敏解决方案。


与已经获得临床许可的BD与梅里埃公司不同,BIOLOG公司提供的微生物鉴定系统还主要以科学研究为主,其可以迅速鉴定超过2500种需氧和厌氧细菌、酵母菌及霉菌。相较于其它劳动强度大的常规鉴定条或鉴定板,BIOLOG最新一代氧化还原化学技术,无需革兰氏染色和其他预试验,便能在同一种鉴定板上对需氧革兰阴性和革兰氏阳性细菌进行微生物鉴定,挑菌、制备菌悬液和接种等预处理只需一分钟即可完成。


作为分析仪器领域的重要成员,Bruker公司也参加了此次展会,其主打的产品是MALDI Biotyper®和MALDI Biotyper® CA微生物鉴定系统,为了进一步提高鉴定的准确率和易操作性,Bruker还开发出了将菌株制备、点靶和工作流程整合起来的Biotyper® Pilot系统及Biotyper® Galaxy系统,真正实现了流程全自动,数据可追溯。

微生物的鉴定现在已可以不再像以往那样需要长时间的培养才能够实现,那还有没有更快更简便的方法呢?一家以色列公司提供这样的新选择。该公司的微生物鉴定系统采用内部荧光检测方法,通过捕捉光子与分子之间相互作用时释放出的光学信号,辅以人工智能的分析软件,从而对目标微生物进行鉴定。该方法可在数分钟之内完成检测、鉴定和计数,无需对微生物进行培养,灵敏度和准确性都很高,更重要的是避免生物危害性废品的产生,还可用于药敏试验的筛选。


药敏检测一直都是临床微生物检测中的重要环节,在此次展会上,除了以往直接依靠培养方式对细菌进行药敏试验的方法,还出现了针对于药敏基因进行检测来判断药敏的分子诊断技术。


Check-point公司展示了碳青霉烯相关基因的实时PCR检测试剂盒,其目的基因包括碳青霉烯,ESBL相关基因及其分型,包括但不限于KPC 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 21, 22, 23, 24, 25; OXA-48, 48b, 162, 163, 181, 204, 232, 244, 245, 370; VIM-1, 2, 3, 4, 5, 6, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47; NDM-1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16;CTX-M-1,2,9,以及SHV-ESBL等。

此外,参展企业提供多达9种临床相关的β-内酰胺酶基因检测,包括但不限于CMY,DHA,CTX‑M-14,CTX‑M,VIM,NDM,IMP,KPC和OXA-48。6种院内常见的革兰氏阴形质粒介导的ampC抗性菌株的检测试剂,这些产品大大丰富了药敏试验的选择,能够更有效的为临床医生提供准确的用药指导。


真菌感染检测一直都缺乏特别有效的手段。在本次展会上,除了常规的1-3 beta D-Glucan检测指标之外,也有不少公司提供关于真菌抗原检测和抗体检测的新选择,包括但不限于曲霉菌,芽生菌,组织胞浆菌,球孢子菌,新型隐球菌,假丝酵母等。


传染病检测向来是临床检测中的一大部分,而各种微生物则是传染病的源头,如何能够快速、准确的检测致病微生物,就是能够快诊断传染病的关键所在。展会现场有多家公司分别提供能够快速检测难辨梭菌、白喉杆菌、百日咳杆菌、副百日咳杆菌、支气管败血性博代菌、霍氏鲍特菌、埃博拉病毒、基孔肯雅病毒、中东呼吸综合症、囊性纤维化、呼吸道病毒(甲型流感/ H1/ H3/2009 H1N1/乙型流感/呼吸道合胞病毒(甲/乙)、副流感病毒(1/2/3)、人偏肺病毒、鼻病毒、腺病毒(B/E/C)、HCV分型(1a,1b,2a/c,2b,3,4,5,6a/b)等多种致病微生物的分子检测方案。部分参展公司依然致力于传染病的POCT检测,比如采用胶体金技术检测新型隐球菌和格特隐球菌。作为一直提供标准血清的丹麦血清研究所,展示了其独有的肺炎链球菌和嗜肺军团菌的双价尿液侧向流检测产品,该产品比Alere旗下的BinaxNOW®肺炎链球菌多一个检测靶标,势必在市场上形成激烈的竞争。


除了对入院患者的检测,相关公司提供在采血和血筛过程中的微生物检测产品,其检测靶标包括金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌、腊样芽胞杆菌、大肠杆菌、无乳链球菌、铜绿假单胞菌、粘质沙雷氏菌、产酸克雷伯菌、产气荚膜梭菌、痤疮丙酸杆菌等。


作为微生物的专业展会,当然会有抗生素生产企业的精彩表现。安斯泰来公司主要介绍旗下的几款抗生素,包括Cresemba®(艾沙康唑鎓硫酸盐),该药品在2015年获得FDA批准用于治疗侵袭性曲霉菌和毛霉菌等真菌感染;AmBiosome®(两性霉素),可用于治疗隐球菌病、皮炎芽生菌(北美芽生菌病)、播散性念珠菌病、球孢子菌病、组织胞浆菌病,以及治疗由毛霉菌、根霉属、犁头霉菌属、内胞霉属和蛙粪霉属等所致的毛霉病等;Mycamine®(米卡芬净钠),用于治疗念珠菌血症与其他念珠菌感染,食道念珠菌感染,预防受造血干细胞移植患者的念珠菌感染。The Medicine Company公司推出了Orbacity®(奥利万星)注射剂和Minocin®(米诺环素)注射剂,用于治疗成人急性细菌皮肤感染,对四环素具有抵抗的患者。


除各类生产企业,诸多相关政府机构也齐聚一堂。德国感染研究中心(www.dzif.de)和欧洲临床微生物与感染疾病协会(www.escmid.org)在展会现场邀请大家现场入会,而美国本土的FDA(Food and Drug Administration,食药监局)、NCBI(National Center for Biotechnology Information)和DOE(Department of Energy,能源部)、NASA(National Aeronautics and Space Administration,美国航天局)等机构也在现场进行宣讲和招聘,他们都有相当数量的研究与微生物相关。


作为一次学术和商业的大会,出版机构怎能缺席呢?ACS(美国化学会)、ASM(美国微生物学会)、AAAS(科学出版社)、Cell、Elsevier、Frontiers、Springer、Wiley等出版集团也都齐聚波士顿,将最新的出版书籍和期刊内容介绍给参会者。


五天的展会在紧张的学习和交流中结束,广大参会者都意犹未尽,希望我们能够在下一次展会上学到更多的内容,获得更好的商机。

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撰写:定向点金海外事务负责人 Will Xavier

编辑:袭莎