贝克曼库尔特生命科学事业部与纽英伦生物技术公司合作进行二代测序应用程序的自动化开发
印第安纳波利斯- (2014年10月20日)- 通过与纽英伦生物技术公司(NEB)的合作,贝克曼库尔特生命科学事业部提出通过开发自动化的方法来改善二代测序(简称为“NGS”)样品制备的过程及通量。根据协议,贝克曼库尔特将运用其在 NGS 样品制备自动化领域的丰富经验为 NEB 的 NEBNext 样品制备试剂盒的自动化提供开发、销售和支持服务,而NEB 则提供试剂、化学和操作流程方面的技术支持。
NEB 公司二代测序的产品市场部经理菲奥纳·斯图尔特(Fiona Stewart)表示:“我们非常高兴能够与贝克曼库尔特生命科学事业部形成这种富有成效的伙伴关系。NEBNext 试剂盒快速及简化的工作流程需要较少的成分和步骤,是适合进行自动化开发的理想产品。结合贝克曼公司可信赖的自动化解决方案,即使面对低量和棘手样品的处理,NEBNext 试剂仍可实现其强大的性能。”
NEBNext 试剂盒的优化方法建立于久经考验的贝克曼库尔特 Biomek 液体处理平台,且每一个解决方案都包含一组独特的 Biomek方法,可用于解决特定的 NEBNext 试剂盒方案。为了能改善整个工作流程,这些方法包括了应用DNA纯化的贝克曼库尔特 AMPure XP 试剂盒,进行高通量DNA片段分选的SPRIselect 试剂盒,以及qPCR体系构建和浓度归一化流程的自动化方法。
“贝克曼库尔特的关注点在于为我们的 NGS 客户提供一流的自动化样品制备解决方案组合,这使我们与 NEB —— 全球领先的为分子生物学研究提供高品质试剂系统的供应商的合作关系成为天作之合,”贝克曼自动化基因组学解决方案的高级市场经理艾丽莎·杰克逊(Alisa Jackson)说道,“我们的联合协作有科学研究人员的参与,并引领了高质量方法的开发,可对一些最棘手的样本,提高处理的效率、通量和结果。”
我们与来自欧洲分子生物学实验室(简称为“EMBL”)、达特茅斯盖泽尔医学院的基因组学和分子生物学共享资源(简称为“GMBSR”)以及诺里斯癌症中心等多个研究机构的科学家们进行了合作实验,在 Biomek 4000 及包含96通道和8通道双机械臂的Biomek FXp平台上使用 NGS 的配置开发了第一批 NEBNext 自动化方法。这些方法创建出96个即用的文库,可在Illumina? 和Ion Torrent? 测序平台上产生优质的结果。
“如今我们为 EMBL 及其欧洲网络中超过 400 名科学家提供 NGS 服务。他们期望得到快速且优质的实验结果。方案务必稳健,能解决低量或棘手的样品类型,” 来自德国海德尔堡EMBL研究分部GeneCore实验室的高级自动化工程师Jürgen Zimmermann博士如是说,“我们依靠与一流企业贝克曼和 NEB 合作开发的自动化解决方案,为我们的客户创建高质量的 DNA和RNA文库。”
GeneCore 实验室的负责人弗拉基米尔·贝内斯(Vladimir Benes)博士表示:“我们共同开发的全自动化方法将在保证稳定质量的基础上大大提升生产力,同时为我们的研究小组赢得时间以专注于棘手的样品并建立新的方法。”
达特茅斯盖泽尔医学院的基因组学和分子生物学共享资源(简称为“GMBSR”)以及达特茅斯大学的希区柯诺里斯癌症中心的联席主任乔安娜·汉密尔顿(Joanna Hamilton)博士表示:“通过Biomek 4000 上自动化的NEBNext文库制备方法,与手动操作相比我们能够产生重复性更好的文库,这不仅节约了我们的劳动力成本,同时也能为利用我们的核心设施进行 NGS 项目的客户带来更快的周转时间。”
现有的 NEBNext 方法包括 Ultra Directional RNA、Ultra DNA(适用于Illumina的平台),以及 Fast DNA Fragmentation & Library Prep(快速 DNA 片段及文库制备)(适用于 Ion Torrent 系统)。在今年晚些时候,NEB 还将推出其它 NEBNext 方法,包括核糖体 RNA 去除和Small RNA 试剂盒。
贝克曼库尔特生命科学事业部拥有一个不断发展的 NGS 样品制备自动化方法的文库。请登录 www.BeckmanNGS.com 以获取更多资讯和现有方法清单。NEB 公司生产的用于文库制备的NEBNext 试剂包括 DNA和RNA 试剂盒,其中包括Small RNA,并可同时用于 Illumina 和 Ion Torrent 的 NGS 平台。请登录 www.NEBNext.com 以获取更多资讯。
*Biomek 4000仅用于科研,不用于临床诊断。
贝克曼库尔特生命科学事业部的Biomek 4000