NCI打造癌症基因组数据共享平台
近日，美国国家癌症研究所(NCI)与芝加哥大学合作基因组数据共享(GDC)平台，存储以及共享癌症基因组计划中的数据。
NCI已收集了来自1万多名病人肿瘤基因组数据。由于这些数据存放地点不同，保存格式不同，对分析研究造成了困难。医学研究所发布的一份报告指出，科学家们迫切需要一个系统，来存储、共享和分析现有的癌症基因组数据。
GDC将参考谷歌和Facebook等公司的数据存储和分析方法，集中和共享NCI的全部基因数据，并标准化所有数据格式，从而方便访问基因组数据。GDC还计划创建云平台，允许研究人员远程分析大型数据并提供开源软件。GDC将为研究者和临床医生提供一个交互系统，便于他们上传癌症基因组数据，分析基因组数据以确定癌症的分子亚型和潜在的治疗靶点。从而为病患确定最佳潜在治疗方案。
GDC将在未来的数年内完成，并将制定法律条例从而确保基因数据能被合法的共享。GDC也不会限制访问人员所处机构的大小或科研预算的多少。
随着基因组测序技术的不断发展，基因组数据越来越多，高质量的基因组数据，其可用性和相关临床应用显得极其重要。TCGA项目主任Zenklusen博士说：“NCI的目标是为所有研究人员提供更多的资源，帮助他们实现科学设想，获得新的科学发现。”
日前，芝加哥大学正在升级专门用于生物科学和医学研究的超级计算机”Beagle”， 结合有较好保密性的Bionimbus云平台，能为科学家们提供世界上最先进的基因组分析平台。利用芝加哥大学在生物计算领域的优良资源，NCI的基因组数据共享平台能将全美国的科学家联系在一起，加快癌症研究，推进个性化医疗服务。
